MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 22084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000922	ATG	2	6	16	21	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617930
2	NC_000922	CCT	2	6	32	37	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15617930
3	NC_000922	AGC	2	6	42	47	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617930
4	NC_000922	CTT	2	6	70	75	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617930
5	NC_000922	AGCA	2	8	98	105	50 %	0 %	25 %	25 %	15617930
6	NC_000922	ATA	2	6	128	133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617930
7	NC_000922	CA	3	6	168	173	50 %	0 %	0 %	50 %	15617930
8	NC_000922	AAT	2	6	181	186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617930
9	NC_000922	ATTTA	2	10	187	196	40 %	60 %	0 %	0 %	15617930
10	NC_000922	AG	3	6	248	253	50 %	0 %	50 %	0 %	15617930
11	NC_000922	AAT	2	6	265	270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617930
12	NC_000922	GAA	2	6	597	602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617931
13	NC_000922	CTT	2	6	667	672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617931
14	NC_000922	AAG	2	6	697	702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617931
15	NC_000922	TGA	2	6	719	724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617931
16	NC_000922	GTA	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617931
17	NC_000922	GA	3	6	776	781	50 %	0 %	50 %	0 %	15617931
18	NC_000922	T	7	7	972	978	0 %	100 %	0 %	0 %	15617932
19	NC_000922	ATAGA	2	10	980	989	60 %	20 %	20 %	0 %	15617932
20	NC_000922	AGGT	2	8	1004	1011	25 %	25 %	50 %	0 %	15617932
21	NC_000922	ATA	2	6	1127	1132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617932
22	NC_000922	ACA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15617932
23	NC_000922	ACC	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15617932
24	NC_000922	TGT	2	6	1206	1211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15617932
25	NC_000922	AGAA	2	8	1212	1219	75 %	0 %	25 %	0 %	15617932
26	NC_000922	A	6	6	1222	1227	100 %	0 %	0 %	0 %	15617932
27	NC_000922	CAA	2	6	1280	1285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15617932
28	NC_000922	TTC	2	6	1347	1352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617932
29	NC_000922	GGA	2	6	1414	1419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617932
30	NC_000922	GCA	2	6	1435	1440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617932
31	NC_000922	AGA	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617932
32	NC_000922	ATG	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617932
33	NC_000922	AG	3	6	1609	1614	50 %	0 %	50 %	0 %	15617932
34	NC_000922	TGA	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617932
35	NC_000922	TCT	2	6	1721	1726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617932
36	NC_000922	GAAGGA	2	12	1744	1755	50 %	0 %	50 %	0 %	15617932
37	NC_000922	TGTGGA	2	12	1764	1775	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15617932
38	NC_000922	TA	3	6	1803	1808	50 %	50 %	0 %	0 %	15617932
39	NC_000922	CTG	2	6	1823	1828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15617932
40	NC_000922	TC	3	6	1914	1919	0 %	50 %	0 %	50 %	15617932
41	NC_000922	TGTCT	2	10	1974	1983	0 %	60 %	20 %	20 %	15617932
42	NC_000922	GA	3	6	1987	1992	50 %	0 %	50 %	0 %	15617932
43	NC_000922	TAT	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617932
44	NC_000922	GTGC	2	8	2023	2030	0 %	25 %	50 %	25 %	15617932
45	NC_000922	AGG	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617932
46	NC_000922	CAA	2	6	2269	2274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15617932
47	NC_000922	GTT	2	6	2350	2355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15617932
48	NC_000922	AGG	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617932
49	NC_000922	TC	3	6	2593	2598	0 %	50 %	0 %	50 %	15617933
50	NC_000922	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617933
51	NC_000922	GAG	2	6	2686	2691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617933
52	NC_000922	AGA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617933
53	NC_000922	CTT	2	6	2887	2892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617933
54	NC_000922	GAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617933
55	NC_000922	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15617933
56	NC_000922	CTAC	2	8	3133	3140	25 %	25 %	0 %	50 %	15617933
57	NC_000922	GAAAA	2	10	3153	3162	80 %	0 %	20 %	0 %	15617933
58	NC_000922	A	7	7	3159	3165	100 %	0 %	0 %	0 %	15617933
59	NC_000922	AG	3	6	3185	3190	50 %	0 %	50 %	0 %	15617933
60	NC_000922	TA	3	6	3252	3257	50 %	50 %	0 %	0 %	15617933
61	NC_000922	T	6	6	3378	3383	0 %	100 %	0 %	0 %	15617933
62	NC_000922	ATG	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617933
63	NC_000922	GAG	2	6	3606	3611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617933
64	NC_000922	GCT	2	6	3632	3637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15617933
65	NC_000922	GGT	2	6	3680	3685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15617933
66	NC_000922	CAG	2	6	3772	3777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617933
67	NC_000922	CTC	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15617933
68	NC_000922	GAAC	2	8	3800	3807	50 %	0 %	25 %	25 %	15617933
69	NC_000922	T	6	6	4158	4163	0 %	100 %	0 %	0 %	15617934
70	NC_000922	CTT	2	6	4191	4196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617934
71	NC_000922	CTA	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15617934
72	NC_000922	AGA	2	6	4225	4230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617934
73	NC_000922	TAAA	2	8	4341	4348	75 %	25 %	0 %	0 %	15617934
74	NC_000922	ATC	2	6	4392	4397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15617934
75	NC_000922	TAA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617934
76	NC_000922	AAGG	2	8	4436	4443	50 %	0 %	50 %	0 %	15617934
77	NC_000922	TTG	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15617934
78	NC_000922	CT	3	6	4502	4507	0 %	50 %	0 %	50 %	15617934
79	NC_000922	A	6	6	4555	4560	100 %	0 %	0 %	0 %	15617934
80	NC_000922	TAG	2	6	4653	4658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617934
81	NC_000922	TTC	2	6	4717	4722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617934
82	NC_000922	TGATAT	2	12	4816	4827	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15617934
83	NC_000922	ACT	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15617934
84	NC_000922	AGGG	2	8	4887	4894	25 %	0 %	75 %	0 %	15617934
85	NC_000922	CTGT	2	8	4896	4903	0 %	50 %	25 %	25 %	15617934
86	NC_000922	AGT	2	6	4922	4927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617934
87	NC_000922	GAAA	2	8	4976	4983	75 %	0 %	25 %	0 %	15617934
88	NC_000922	AGG	2	6	5038	5043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617934
89	NC_000922	AAT	2	6	5060	5065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617934
90	NC_000922	AT	3	6	5064	5069	50 %	50 %	0 %	0 %	15617934
91	NC_000922	CAG	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617934
92	NC_000922	CATC	2	8	5197	5204	25 %	25 %	0 %	50 %	15617934
93	NC_000922	TTA	2	6	5442	5447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617934
94	NC_000922	GATA	2	8	5566	5573	50 %	25 %	25 %	0 %	15617934
95	NC_000922	CAG	2	6	5598	5603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617934
96	NC_000922	TTA	2	6	5607	5612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617934
97	NC_000922	CT	3	6	5726	5731	0 %	50 %	0 %	50 %	15617934
98	NC_000922	CTG	2	6	5766	5771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15617934
99	NC_000922	TTC	2	6	5858	5863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617934
100	NC_000922	ATAAA	2	10	5868	5877	80 %	20 %	0 %	0 %	15617934
101	NC_000922	AAG	2	6	5898	5903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617934
102	NC_000922	ACAG	2	8	5989	5996	50 %	0 %	25 %	25 %	15617934
103	NC_000922	TTC	2	6	6029	6034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617934
104	NC_000922	AAT	2	6	6101	6106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617934
105	NC_000922	TAG	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617934
106	NC_000922	CAA	2	6	6181	6186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15617934
107	NC_000922	TC	3	6	6289	6294	0 %	50 %	0 %	50 %	15617934
108	NC_000922	AAG	2	6	6295	6300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617934
109	NC_000922	TTC	2	6	6303	6308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617934
110	NC_000922	T	6	6	6331	6336	0 %	100 %	0 %	0 %	15617934
111	NC_000922	CCA	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15617934
112	NC_000922	TTG	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15617934
113	NC_000922	GGAG	2	8	6437	6444	25 %	0 %	75 %	0 %	15617934
114	NC_000922	GAC	2	6	6544	6549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617934
115	NC_000922	GCT	2	6	6704	6709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15617934
116	NC_000922	GCA	2	6	6743	6748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617934
117	NC_000922	GCC	2	6	6840	6845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15617934
118	NC_000922	TATAA	2	10	6860	6869	60 %	40 %	0 %	0 %	15617934
119	NC_000922	CT	3	6	7259	7264	0 %	50 %	0 %	50 %	15617935
120	NC_000922	ATT	2	6	7650	7655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617936
121	NC_000922	GGT	2	6	7665	7670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15617936
122	NC_000922	TTC	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617936
123	NC_000922	TG	3	6	7752	7757	0 %	50 %	50 %	0 %	15617936
124	NC_000922	TGCT	2	8	7759	7766	0 %	50 %	25 %	25 %	15617936
125	NC_000922	TTC	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617936
126	NC_000922	GAA	2	6	7787	7792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617936
127	NC_000922	TATTTC	2	12	7859	7870	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15617936
128	NC_000922	ATT	2	6	7980	7985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617936
129	NC_000922	GTG	2	6	7996	8001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15617936
130	NC_000922	TTC	2	6	8045	8050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617936
131	NC_000922	TG	3	6	8082	8087	0 %	50 %	50 %	0 %	15617936
132	NC_000922	TGCT	2	8	8089	8096	0 %	50 %	25 %	25 %	15617936
133	NC_000922	TTC	2	6	8110	8115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617936
134	NC_000922	GAA	2	6	8117	8122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617936
135	NC_000922	TATTTC	2	12	8189	8200	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15617936
136	NC_000922	ATT	2	6	8310	8315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617936
137	NC_000922	GTG	2	6	8326	8331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15617936
138	NC_000922	TTC	2	6	8375	8380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617936
139	NC_000922	GTGCTT	2	12	8395	8406	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15617936
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271	NC_000922	GAA	2	6	17108	17113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617942
272	NC_000922	AGG	3	9	17116	17124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617942
273	NC_000922	AAG	2	6	17196	17201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617942
274	NC_000922	AGA	2	6	17270	17275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617942
275	NC_000922	AT	4	8	17281	17288	50 %	50 %	0 %	0 %	15617942
276	NC_000922	GAA	2	6	17361	17366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617942
277	NC_000922	AAG	2	6	17381	17386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617942
278	NC_000922	AAG	2	6	17403	17408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617942
279	NC_000922	TGG	2	6	17469	17474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15617942
280	NC_000922	AGA	2	6	17525	17530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617942
281	NC_000922	CCTA	2	8	17626	17633	25 %	25 %	0 %	50 %	15617942
282	NC_000922	GAAA	2	8	17764	17771	75 %	0 %	25 %	0 %	15617942
283	NC_000922	AG	3	6	17826	17831	50 %	0 %	50 %	0 %	15617942
284	NC_000922	CTCA	2	8	17832	17839	25 %	25 %	0 %	50 %	15617942
285	NC_000922	AGA	2	6	17873	17878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617942
286	NC_000922	TA	3	6	17904	17909	50 %	50 %	0 %	0 %	15617942
287	NC_000922	GAG	2	6	17976	17981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617942
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289	NC_000922	CTT	2	6	17994	17999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617942
290	NC_000922	CT	3	6	18053	18058	0 %	50 %	0 %	50 %	15617942
291	NC_000922	TGA	2	6	18065	18070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617942
292	NC_000922	TTA	2	6	18078	18083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617942
293	NC_000922	AAGA	2	8	18096	18103	75 %	0 %	25 %	0 %	15617942
294	NC_000922	ACA	2	6	18122	18127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15617942
295	NC_000922	AGAT	2	8	18137	18144	50 %	25 %	25 %	0 %	15617942
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298	NC_000922	TTA	2	6	18644	18649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617943
299	NC_000922	GCT	2	6	18653	18658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15617943
300	NC_000922	CAA	3	9	18705	18713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15617943
301	NC_000922	CAT	2	6	18729	18734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15617943
302	NC_000922	CTA	2	6	18813	18818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15617943
303	NC_000922	GTT	2	6	18819	18824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15617943
304	NC_000922	AGG	2	6	18862	18867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617943
305	NC_000922	TTTC	2	8	18873	18880	0 %	75 %	0 %	25 %	15617943
306	NC_000922	GCT	2	6	18917	18922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15617943
307	NC_000922	AGC	2	6	18934	18939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617943
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310	NC_000922	AATT	2	8	19108	19115	50 %	50 %	0 %	0 %	15617943
311	NC_000922	CTTT	2	8	19151	19158	0 %	75 %	0 %	25 %	15617943
312	NC_000922	TTC	2	6	19171	19176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617943
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314	NC_000922	GCT	2	6	19262	19267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15617943
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352	NC_000922	TTTC	2	8	31053	31060	0 %	75 %	0 %	25 %	15617944
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363	NC_000922	GAG	2	6	32020	32025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617944
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372	NC_000922	C	6	6	32325	32330	0 %	0 %	0 %	100 %	15617944
373	NC_000922	AAG	2	6	32367	32372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617944
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382	NC_000922	GA	3	6	32962	32967	50 %	0 %	50 %	0 %	15617945
383	NC_000922	T	8	8	32971	32978	0 %	100 %	0 %	0 %	15617945
384	NC_000922	GAT	2	6	33025	33030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617945
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386	NC_000922	AGT	2	6	33112	33117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617945
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388	NC_000922	TAGG	2	8	33177	33184	25 %	25 %	50 %	0 %	15617945
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391	NC_000922	AG	3	6	33405	33410	50 %	0 %	50 %	0 %	15617945
392	NC_000922	CTC	2	6	33526	33531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15617945
393	NC_000922	TGCT	2	8	33535	33542	0 %	50 %	25 %	25 %	15617945
394	NC_000922	T	6	6	33542	33547	0 %	100 %	0 %	0 %	15617945
395	NC_000922	CTT	2	6	33567	33572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617945
396	NC_000922	GCT	3	9	33596	33604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15617945
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398	NC_000922	GTA	2	6	33649	33654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617945
399	NC_000922	CTT	2	6	33696	33701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617945
400	NC_000922	GAG	2	6	33708	33713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617945
401	NC_000922	GAA	2	6	33744	33749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617945
402	NC_000922	TTG	2	6	33757	33762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15617945
403	NC_000922	TTC	2	6	33844	33849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617945
404	NC_000922	TTC	2	6	33892	33897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617945
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